克唑替尼(crizotinib)和劳拉替尼间变性淋巴瘤激因子分析-

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摘要

基于结构的药品设计(SBDD)通常用于合理的药品设计中。通常,利用来自晶体学数据的配体和结合位点原子坐标来优化效能和选择性。除了蛋白质和配体的传统静态视图外

  基于结构的药品设计(SBDD)通常用于合理的药品设计中。通常,利用来自晶体学数据的配体和结合位点原子坐标来优化效能和选择性。除了蛋白质和配体的传统静态视图外,我们建议使用归一化的B因子来研究蛋白质动力学,作为药品优化过程的一部分。克唑替尼(crizotinib)和劳拉替尼结合c-ros癌基因1激酶(ROS1)和间变性淋巴瘤激酶(ALK)L1196M的回顾性病例研究将归一化的B因子与结合亲和力的差异相关。

  该分析表明,配体结合能够具有蛋白质稳定作用,该作用始于配体附近,但通过附近的残基和结构水传播至更远的基序。还讨论了分析SBDD中归一化B因子的潜在机遇。蛋白质具有灵活性和高度动态性,其运动范围从皮秒级的快速振动,幅度小于0.5Å到构象变化(长达103秒并清除大于10Å)。蛋白质晶体的X射
克唑替尼(crizotinib)和劳拉替尼间变性淋巴瘤激因子分析-
线分析具有和没有结合配体的结构一直是基于结构的药品设计(SBDD)的关键工具。尽管在了解蛋白质的氨基酸残基构象和二级结构方面已有许多工作,但1-4的工作较少,而是专注于在SBDD中使用蛋白质动力学。

  B因子(也称为温度因子或原子位移参数)是X射线晶体结构中的计算参数,这些参数从原子的理想平衡位置反映了由于热运动和位置无序而导致的原子无序。在不同温度下进行的晶体学研究表明,一般而言,动力学对原子B因子的影响要比晶格紊乱大得多。2B因子可洞悉晶体状态下的蛋白质动态运动,可用于作为解决方案状态下的运动模型。

  实际上,按体积测量,典型的蛋白质晶体由40-60%的溶剂组成。 B因子可洞察晶体状态下蛋白质的动态运动,可将其用作溶液状态下运动的模型。归一化的B因子测量用于对比多个结构上的运动。归一化B因子(B')是B因子(B)的表达,以标准差(σB)为单位,以平均值为单位。该值是通过蛋白质-配体复杂的晶体结构中的所有重原子计算得出的。劳拉替尼30天好多钱?在哪里能够选购?详情可咨询下方【微信:yaodaoyaofang】。

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